对于计算机应用工程专业的学生或从业者来说，选择合适的软考科目应结合个人兴趣、职业发展方向以及考试难度等因素综合考虑。以下是针对该专业的推荐科目及理由：

1.中级科目推荐

(1)软件设计师

软件设计师是软考中级中技术性较强的科目，适合计算机应用工程专业的学生。考试内容涵盖数据结构、算法、软件工程、程序设计语言(如C++、Java)等，与计算机应用专业的核心课程高度契合。

职业优势：该证书在软件开发、系统设计等岗位具有较高认可度，适合未来从事软件研发、系统架构等工作的考生。

(2)网络工程师

如果对计算机网络感兴趣，网络工程师是一个不错的选择。考试内容包括网络协议、网络安全、网络设备配置等，适合从事网络管理、系统运维等方向的考生。

职业优势：适合进入企业IT部门、互联网公司或网络服务提供商，从事网络规划、运维等工作。

(3)系统集成项目管理工程师

如果希望向管理方向发展，该科目偏重项目管理知识(如进度、成本、风险管理)，计算机技术内容较少，适合非纯技术背景或希望转型管理的考生。

职业优势：证书在企业招投标、IT项目管理岗位中有较高价值，且考试难度相对较低，适合快速拿证。

(4)信息安全工程师

随着网络安全需求增长，该科目涉及密码学、安全防护技术等，适合对网络安全感兴趣的考生。

职业优势：适合从事安全运维、渗透测试、安全咨询等工作，市场需求大，薪资较高。

2.高级科目推荐(适合有工作经验者)

(1)信息系统项目管理师

高级中最热门的科目，偏重项目管理，适合IT行业从业者提升管理能力。考试包含论文写作，但技术难度较低，适合长期职业发展。

职业优势：可担任高级项目经理、IT总监等职位，对职称评定、积分落户等有帮助。

(2)系统架构设计师

适合技术背景强、希望从事系统架构设计的考生。考试涉及软件架构、中间件、高并发系统设计等，技术深度较高。

职业优势：适合进入大型互联网公司或软件企业，担任架构师等高级技术职位。

3.选择建议

技术路线：如果希望深耕技术，推荐软件设计师(中级)→系统架构设计师(高级)。

管理路线：如果倾向于项目管理，推荐系统集成项目管理工程师(中级)→信息系统项目管理师(高级)。

就业需求：目前市场对信息安全工程师、网络工程师需求较大，可结合行业趋势选择。

建议总结：计算机应用工程专业考生可根据自身兴趣和职业规划选择：

技术方向：软件设计师、网络工程师、信息安全工程师。

管理方向：系统集成项目管理工程师、信息系统项目管理师。

高级进阶：系统架构设计师(技术)、信息系统项目管理师(管理)。

建议结合个人基础和学习能力选择，中级证书可作为职业敲门砖，高级证书则更适合长期发展。